光绪二十七年（1901年）十月，慈禧太后和光绪帝回銮北京，他欲前往开封迎驾，但无人为之先容，只好作罢。光绪三十年（1904年）四月，因慈禧太后七十大寿，下令将戊戌年革职人员开复原官，监禁交地方管束者一概释放。翁同龢见此消息，说：“逋臣如得邀此宽典，虽一息尚存，当伏谒君门。”他虽免于管束，但并未开复原官。随后他坐船游览苏州、杭州、萧山。回家后，他就卧病在床，张謇曾在五月十八日到虞山探病，谈论立宪问题，翁同龢极力赞成。二十一日，翁同龢病危，向守候在身边的亲属口占一诀：“六十年中事，伤心到盖棺。不将两行泪，轻向汝曹弹。”又引用《论语》章句自撰挽联一副：“朝闻道，夕死可矣；今而后，予知免夫。”最后口授遗疏，委托张謇代书陈奏。遗命葬事从简，身后不得铺张。同日夜间逝世，葬于虞山鹁鸽峰祖坟西偏方向。 [14]
翁同龢死后，庆亲王奕劻曾请求为他开复原官，被慈禧太后拒绝。宣统元年（1909年）十月初三日，在两江总督端方的请求下，翁同龢被清廷开复原官。中华民国三年（1914年），在遗老邹嘉来、吴郁生等的请求下，逊帝溥仪追谥“文恭”。 [14]
主要影响
播报
编辑
政治方面
培养皇帝
翁同龢书法
同治帝和光绪帝两代皇帝登基时年幼，专门从文臣中挑选师傅来辅导“圣学”，翁同龢荣膺“两代帝师”。他从同治四年（1865年）至同治十三年（1874年）在弘德殿行走，授读同治帝；光绪二年（1876年）到光绪二十二年（1896年）又在毓庆宫行走，授读光绪帝。光绪九年（1883年）七月，慈禧太后曾面谕翁同龢：此后“书房汝等主之”。可以说，这以后10多年的宫廷教育主要由翁同龢来主持。翁同龢根据同治帝、光绪帝任性、多病，对传统授课方式产生厌学的情况，对教学方法进行调整：
由浅入深，灌输与启发并重。翁同龢给同治帝授读《帝鉴图说》，一改
明白透彻、浅显易懂、通畅生动，同治帝听得颇有兴趣。为提高同治帝阅读古文的能力，特别是文言虚词的使用，翁同龢将常用文言虚词集录成册，附上例文注释，供同治帝阅看翁同龢给同治帝选讲《帝鉴图说》一书中的有关章节，并把所讲内容与现实社会政治结合起来，对同治帝的长进起了一定作用。如同治帝在听了《唐宪宗却贡》一节后表示：“贡献皆取之于民，吾亲政后，当效法宪宗，不受贡物。”翁同龢针对光绪帝爱看图画一类的书，就经常寻购图文并茂、通俗易懂的书画呈送光绪帝阅读，如在上海购买法国冕西土加尼编写的《探路记》汉译插图本呈送光绪帝观看，既激发其读书兴趣，又帮助其提高胆量。